Namnet förekommer redan i början av 1300-talet. Enligt uppgift försvann byn någon gång på 1860-talet.
Riksantikvarieämbetets nr 163 – Bebyggelselämningar – SÖ delen av större åkerholme.
Tidigaste belägg är 1311, då det benämndes Skiedberga, Ortsnamnsarkivet i Uppsala.
Enligt jordeboken 1758 är Skällberga ett frälsehemman under Nyborgs säteri och ägs av Herr Liutenanten Drufva
Lagaskifteskartan 1842 –43 har två husgrunder.
Både Skällsta och Nyborg har ägt delar i Skällberga by och boende fram till 1845.